El Centro de Inteligencia Estratégica (CIES), encargado de producir información de inteligencia para la seguridad nacional, enfrenta señalamientos por robo y desaparición de bienes, según auditorías de la Contraloría General del Estado. Con la Ley Orgánica de Inteligencia, vigente desde el 11 de junio de 2025, el CIES se transformará en el Sistema Nacional de Inteligencia (SNI), lo que implicará una reestructuración administrativa y evaluación de su personal. Su funcionamiento, clasificado como secreto, solo es supervisado por la Comisión de Seguridad de la Asamblea Nacional y la Contraloría.
En 2023, el CIES manejó un presupuesto inicial de $22.071.238, que creció a $69.799.777,05, destinando $65.570.000 a gastos especiales. Estos gastos, controlados exclusivamente por el contralor, son revisados trimestralmente y los documentos se destruyen. Desde 2012, la Contraloría realizó 26 exámenes especiales, emitiendo 188 recomendaciones, de las cuales 180 se cumplieron bajo la dirección de Fausto Cobo, nombrado por el expresidente Guillermo Lasso.
Creado en 2009 como Secretaría Nacional de Inteligencia (Senain) bajo Rafael Correa, el CIES cambió de nombre en 2018 durante la presidencia de Lenín Moreno. Una auditoría de ese año reveló que, de 4.396 bienes registrados, 3.582 estaban documentados, 19 “perdidos” (indemnizados por $8.710), 493 no localizados ($1.365.320) y 25 bienes muebles desaparecidos ($18.814). Además, 340 bienes del Data Center no pudieron verificarse para evitar pérdida de información.
Las auditorías también detectaron irregularidades en la gestión de activos. En 2018, se denunciaron el robo de 18 bienes, el hurto de cinco y la pérdida de dos iPhone 7 ($2.434), pero las denuncias se presentaron en la Fiscalía con 24 días de retraso. En 2021, se reportaron 849 bienes desaparecidos, denunciados 233 días después, con justificaciones de retrasos por la pandemia de COVID-19. Los frecuentes cambios de directores y funcionarios dificultaron el seguimiento de trámites internos.
Otros hallazgos incluyen siete de 19 vehículos registrados a nombre de terceros, uno de ellos a una mujer con vínculo familiar a un servidor. En 2023, el CIES produjo 5.734 productos de inteligencia, pero no hay datos sobre 2024. Con la reestructuración liderada por el presidente Daniel Noboa, el SNI tendrá un director designado por el Ejecutivo y personal seleccionado mediante pruebas de confianza, mientras las irregularidades reveladas urgen medidas para garantizar la transparencia y seguridad en la gestión de inteligencia.